آسوشیتدپرس – قالیباف به سرکوب دانشجویان شناخته می شود
. بسیاری قالیباف را بعنوان سرکرده سپاه پاسداران بخاطر سرکوب دانشجویان در سال ۱۳۷۸ بخاطر می آورند. در اثر خشونت علیه این اعتراضات چندین نفر کشته و صدها نفر مجروح و هزاران نفر دستگیر شدند. او همچنین زمانی که رئیس پلیس بود دستور استفاده از مهمات جنگی را علیه دانشجویان در سال ۱۳۸۲ صادر کرد
انتخاب قالیباف در شرایطی است که آمریکا معافیت های برنامه اتمی رژیم ایران را اواخر چهارشنبه لغو کرد و تنش ها میان دوکشور همچنان بالاست